MUESTRAS CLÍNICAS RECOMENDADAS PARA DIAGNÓSTICO MICROBIOLÓGICO |
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TIPOS DE INFECCIÓN | MUESTRA | COMENTARIOS | |
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Bacteriemia | Sangre |
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Infecciones cardiovasculares y asociadas a dispositivos intravasculares | Sangre (venopunción y a través de catéter) catéter iv/ Piel pericatéter/Conexión del catéter | ||
Endocarditis | Sangre/válvula/verrugas/ |
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Pericarditis | Líquido pericárdico |
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Sistema nervioso central | |||
Meningitis-encefalitis | LCR, hemocultivo |
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Absceso cerebral | Aspirado del absceso |
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Tracto respiratorio | |||
Faringoamigdalitis | Exudado faríngeo |
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Estudio de portador de S.aureus | Nasal |
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Estudio de portador de gonococo | Exudado faríngeo |
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Sinusitis | Aspirado sinusal |
No válido exudado nasal |
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Otitis media | Tímpanocentesis |
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Otitis externa | Exudado oído externo |
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Neumonía | Hemocultivo, esputo, BAS, BAL, CTO, punción transtorácica |
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Empiema y abscesos pulmonares | Líquido pleural, aspirado absceso |
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Tosferina | Lavado nasofaríngeo |
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Infecciones oculares | |||
Conjuntivitis | Exudado conjuntival/raspado |
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Queratitis | Raspado corneal |
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Queratitis por lentillas | Raspado corneal, lentilla y líquido de lentillas |
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Endoftalmitis | Líquido intraocular |
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Infecciones gastrointestinales | |||
Diarrea | Heces/biopsia intestinal/aspirado duodenal |
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Infecciones intraabdominales | |||
Peritonitis | Líquido peritoneal |
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Abscesos intraperitoneales o viscerales | Aspirado absceso |
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Colecistitis | Aspirado biliar, hemocultivo |
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Infección del tracto urinario | |||
Infección de orina | Orina por micción limpia o sondaje
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Diagnóstico de bacteriuria por anaerobios y de ITU en niños |
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Tracto genital | |||
Cervicitis | Exudado endocervical |
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Detección de Streptococcus agalactiae | Exudado vágino-rectal, vaginal o rectal |
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Nódulos genitales | Aspirado nódulo |
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Prostatitis | Secreción prostática |
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Úlceras genitales | Frotis úlcera |
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Uretritis | Exudado uretral |
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Verrugas genitales | Frotis verruga, biopsia |
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Virus del papiloma humano (VPH) | Exudado endocervical o vulvar |
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Vulvovaginitis | Exudado vaginal |
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Piel y tejidos blandos | |||
Impétigo, foliculitis, erisipela, celulitis, úlceras, gangrena, abscesos cutáneos, heridas y quemaduras | Aspirados tomados con jeringa y biopsia de tejido. |
Poco recomendables las recogidas con escobillón. |
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Huesos y articulaciones | |||
Artritis | Líquido sinovial |
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Osteomielitis | Biopsia ósea o exudado |
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Prótesis | Exudado |
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RECOGIDA, TRANSPORTE Y CONSERVACIÓN DE LAS MUESTRAS |
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Normas generales: Las torundas con medio de transporte sólido han sido sustituidas por torundas con medio de transporte líquido, lo que permite tanto la siembra convencional como como las determinaciones moleculares. Todas las muestras que se recojan en estas torundas pueden mantenerse a temperatura ambiente/4ºC hasta su envío al laboratorio de microbiología. Las biopsias nunca deben enviarse en formol. |
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MUESTRA | DETERMINACIÓN | ENVASE | COMENTARIOS |
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Abscesos | Bacterias (cultivo) | Jeringa ocluida (sin aguja), frascos de hemocultivo, tioglicolato. | Tomar la muestra tras limpieza y desinfección adecuada. Siempre que sea posible, obtener la muestra por aspiración. Las muestras de abscesos pueden inocularse en frasco de hemocultivo, aunque es conveniente en este caso enviar además muestra para su siembra directa en placas. Poco recomendable las recogidas con escobillón. |
Aspirado duodenal | Giardia lamblia (microscopía) | Envase estéril de boca ancha, previamente calentado a 37ºC. | Enviar inmediatamente al laboratorio. Si la muestra se enfría es difícil observar los trofozoítos de Giardia |
Aspirado/exudado nasofaríngeo | Bacterias (cultivo/PCR) Virus: VRS (IC/PCR), gripe (PCR) |
Envase estéril/torunda flexible Envase estéril. Para gripe, en envase específico |
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Aspirado oído medio (timpanocentesis) | Bacterias/hongos (cultivo) | Envase estéril, jeringa ocluida (sin aguja) | Enviar inmediatamente al laboratorio |
Aspirado sinusal | Bacterias/hongos (cultivo) | Jeringa (enviar sin aguja) o inocular en un tubo de tioglicolato |
No válido exudado nasal Enviar inmediatamente al laboratorio |
BAS, BAL, punción transtorácica, CTO | Bacterias/hongos (cultivo) | Envase estéril de boca ancha | |
Biopsias | Bacterias/hongos (cultivo) Virus (PCR) Micobacterias (tinción, cultivo) |
Envase estéril de boca ancha | Introducir la biopsia en un contenedor con una pequeña cantidad de suero fisiológico estéril. NO usar formol. |
Catéter | Bacterias/hongos (cultivo) | Envase estéril de boca ancha | Segmento distal de no más de 4 cm de longitud. Enviar en sospecha de infección asociada a catéter, siempre junto con hemocultivo No solicitar cultivo sistemáticamente cada vez que se retire un catéter |
Catéter urinario | No aceptable | ||
Catéter drenaje | No recomendable | Enviar líquido drenaje, abscesos, aspirados | |
Esputo | Bacterias, hongos (cultivo) | Envase estéril de boca ancha | Es recomendable enviar el primero de la mañana, tras enjuague de la boca |
Micobacterias (tinción y cultivo) | Envase estéril de boca ancha | Enviar muestras de tres días consecutivos (preferible primera de la mañana) | |
Exudado conjuntival/corneal | Bacterias, hongos (cultivo) | Torunda con medio de transporte, o inocular en tioglicolato | |
Exudado endocervical | Chlamydia trachomatis/gonococo (PCR) | Torunda sin medio de transporte | |
Bacterias (cultivo) | Torunda con medio de transporte (2x) | Enviar inmediatamente al laboratorio | |
VPH (PCR) | Torunda sin medio de transporte (2x) | ||
Exudado faríngeo | Bacterias, hongos (cultivo) | Torunda con medio de transporte | |
Virus: gripe (PCR) | Envase específico. Enviar con exudado nasal | ||
Exudado nasal | S. aureus (cultivo) | Torunda con medio de transporte | Solicitar únicamente para estudio de portadores de Staphylococcus aureus |
Gripe (PCR) | Envase específico. Enviar con exudado faríngeo | ||
Exudado oído externo | Bacterias (cultivo) | Torunda con medio de transporte | |
Exudado rectal | Bacterias (cultivo) | Torunda con medio de transporte | No conservar en nevera si se sospecha ITS |
Chlamydia trachomatis/gonococo (PCR) Virus (PCR) |
Torunda sin medio de transporte | ||
Exudado uretral | Chlamydia trachomatis/gonococo (PCR) | Torunda sin medio de transporte | |
Bacterias (cultivo) | Torunda con medio de transporte | No conservar en nevera si se sospecha ITS | |
Mycoplasma hominis Ureaplasma urealyticum (cultivo) |
Torunda con medio de transporte especial. Llamar al laboratorio | ||
Exudado vaginal | Bacterias, hongos (cultivo) | Torunda con medio de transporte (x2) | No conservar en nevera si se sospecha ITS |
Exudado vagino-rectal | Streptococcus agalactiae (cultivo) | Torunda con medio de transporte | |
Heces | Bacterias (cultivo) | Envase estéril de boca ancha | |
Toxina de Clostridium difficile (IC/PCR) | Envase estéril de boca ancha | ||
Parásitos (microscopía) | Transporte con S.A.F. Portaobjetos en envase estéril de boca ancha |
3 de 3 días no consecutivos. Para investigación de oxiuros, tomar la muestra mediante técnica de Graham (al levantarse por la mañana y antes de lavarse adherir papel autoadhesivo transparente (papel de celo) por los márgenes anales y pegar sobre una de las caras de un portaobjetos, ajustándose a su medida) | |
Rotavirus, adenovirus (IC) | Envase estéril | ||
Heridas, úlceras, quemaduras, mordeduras | Bacterias, hongos (cultivo) | Envase estéril (biopsia), jeringa ocluida (sin aguja), tioglicolato, torunda con medio de transporte | Tomar la muestra tras limpieza y desinfección adecuada. Siempre que sea posible, obtener la muestra por aspiración. Poco recomendables las recogidas con escobillón, preferible enviar biopsia: introducir la muestra en un contenedor con una pequeña cantidad de suero fisiológico estéril y NO usar formol |
Jugo gástrico | Micobacterias (tinción, cultivo/PCR) | Envase estéril de boca ancha | |
Lentes de contacto | Bacterias/hongos (cultivo) Parásitos: Acanthamoeba (microscopía, cultivo) |
Enviar lentes en su estuche y también el frasco de líquido de conservación | |
Lentes terapéuticas | Bacterias/hongos (cultivo) | Envase estéril de boca ancha/tioglicolato | |
Lesiones fúngicas (piel, pelo, uñas) | Hongos (cultivo) | Envase estéril/placa de Petri/torunda sin medio de transporte | |
Líquido amniótico | Bacterias, hongos (cultivo) | Envase estéril, jeringa ocluida (sin aguja), tioglicolato, frascos de hemocultivo | |
Virus (PCR) | Envase estéril | ||
Líquido cefalorraquídeo | Bacterias (cultivo, Ag de neumococo por IC) | Envase estéril | Enviar inmediatamente al laboratorio. Si no es posible, la muestra para cultivo debe dejarse a temperatura ambiente. Para el resto de estudios puede refrigerarse. Si se extrae más de un tubo, enviar el extraído en segundo lugar a Microbiología. Indicar siempre por orden de preferencia los estudios a realizar |
Hongos (cultivo) | Envase estéril | ||
Virus (PCR) | Envase estéril | ||
Serología (ELISA) | Envase estéril | ||
Parásitos | Envase estéril | ||
Micobacterias (tinción, cultivo, PCR) | Envase estéril | ||
Líquidos estériles (articular, ascítico, bilis, pericárdico, peritoneal, pleural) | Bacterias (cultivo) | Envase estéril/frascos de hemocultivo | Enviar inmediatamente al laboratorio. Si no es posible, la muestra para cultivo debe dejarse a temperatura ambiente. Para el resto de estudios puede refrigerarse. Indicar siempre por orden de preferencia los estudios a realizar |
Hongos (cultivo) | Envase estéril | ||
Virus (PCR) | Envase estéril | ||
Parásitos | Envase estéril | ||
Parásitos | Envase estéril | ||
Médula ósea | Bacterias/hongos (cultivo) | Envase estéril/frascos de hemocultivo | |
Parásitos: Leishmania (microscopía) | Envase estéril | ||
Micobacterias (tinción, cultivo, PCR) | |||
Nódulos genitales | Bacterias (cultivo) | Jeringa/ Envase estéril | Aspirado nódulo |
Orina (micción limpia o sondaje) | Bacterias, hongos (cultivo) | Envase estéril de boca ancha, sin conservante Tubos con conservante |
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Antígeno de neumococo/Ag de Legionella (IC) | Envase estéril de boca ancha | ||
Chlamydia/gonococo (PCR) | Envase estéril de boca ancha | ||
Micobacterias (tinción, cultivo) | Envase estéril de boca ancha | Enviar 3 muestras de orina de 3 días consecutivos, con volumen mínimo de 20 ml cada muestra. No enviar muestras de orina de 24 horas | |
Orina punción suprapúbica | Bacterias (cultivo) | Jeringa ocluida | Diagnóstico de bacteriuria por anaerobios y de ITU en niños |
Prótesis y material protésico (prótesis articulares, válvulas, port-a-cath…) | Bacterias (cultivo/PCR 16s) Hongos (cultivo) Micobacterias (tinción, cultivo, PCR 16s) |
Contenedor estéril apropiado según tamaño | Añadir un pequeño volumen de suero fisiológico estéril a las piezas pequeñas para evitar su desecación |
Raspado corneal, córnea, casquete corneal | Bacterias/hongos (cultivo) | Inoculación directa en medios de cultivo (tioglicolato) | Contactar previamente con el S. de Microbiología |
Sangre | Hemocultivo | Frascos de hemocultivo | Realizar siempre dos extracciones de sangre (tres en sospecha de endocarditis) de punciones independientes de vena periférica con un intervalo de entre 10 y 60 minutos. En adultos, cada extracción será de 20 ml (10 ml en frasco aerobio y 10 ml en anaerobio, por este orden). |
Serología | Suero (gelosa) | ||
Virus | Plasma (EDTA o K7) | ||
Carga viral | Plasma (EDTA con gelosa “tubo de tapón blanco”) | ||
Parásitos (tinción, IC) | Sangre no coagulada (EDTA) | ||
Micobacterias | Frasco de hemocultivo especial | Frasco especial para micobacteriosis diseminada o fungemia. Contactar con Microbiología. | |
Secreción prostática | Bacterias, hongos | Envase estéril de boca ancha | |
Semen | Bacterias (cultivo) | Envase estéril de boca ancha | |
Úlceras (frotis) | Virus: VPH, herpes (PCR) | Torunda seca (x2) | |
Válvulas, verrugas cardiacas | Bacterias (cultivo, PCR 16s) Hongos (cultivo) |
Envase estéril de boca ancha | |
Verrugas genitales | VPH | Escobillón seco (x2) | |
NOTA 1: BACTERIEMIA RELACIONADA CON EL CATÉTER Bacteriemia relacionada con reservorio: Extraer una pareja de hemocultivos por punción venosa directa A los 10-15 minutos, extraer una segunda pareja de hemocultivos por punción venosa directa e, inmediatamente después, otra pareja de hemocultivos del reservorio (si son bicamerales, se debe realizar una extracción de 20 ml de cada cámara). Bacteriemia relacionada con catéter venoso central: Extraer una pareja de hemocultivos por punción venosa directa A los 10-15 minutos, extraer una segunda pareja de hemocultivos por punción venosa directa e, inmediatamente después, otra pareja de hemocultivos de la luz 1 y otra de la luz 2. IMPORTANTE - En adultos, el volumen de sangre a inocular en cada frasco es de 10 ml. En niños, el volumen adecuado se indica en la siguiente tabla: |
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Peso <4 kg 4-9 Kg 10-14 Kg 15-20 Kg 21-40 Kg >40 Kg |
Volumen en cada extracción 1 ml 2 ml 3 ml 4 ml 5 ml 10 ml |
Tipo de frasco Pediátrico Pediátrico Pediátrico Adulto (aerobio) Adulto (aerobio) Adulto (aerobio) |
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- Identificar los frascos de hemocultivos con la pegatina del paciente y rotular la procedencia de la sangre inoculada: venopunción 1ª, venopunción 2ª, luz (indicando cual), reservorio. - Debe inocularse la misma cantidad de sangre en todos los frascos. - Enviar lo más rápidamente posible al laboratorio de microbiología, y todos los frascos a la vez. - En una única petición DIRAYA podemos incluir en el laboratorio hasta 3 parejas de hemocultivos: por tanto NO es necesario hacer una petición para cada pareja. - Si este protocolo se realiza correctamente, la sensibilidad y la especificidad son elevadas, pero si no se realiza bien puede llevar a conclusiones erróneas, por lo que no debe hacerse si no existen las condiciones óptimas para ello. |